Missions

L'ingénieur d'études en biologie cellulaire et imagerie consacrera son temps à 70% à la conception
et à la réalisation expérimentale de projets de recherche (Imagerie en 2D et 3D) pour les équipes
de l'IGFL utilisant des modèles organoïdes et assembloïdes mammifères. Pour les 30% restant, son
activité sera mutualisée avec la plateforme transversale "Imagerie et analyse d'images" de l'IGFL.

Activités

**Activités de recherche pour les équipes de l'IGFL (70%)**
-Développer des systèmes ex-vivo et les imager en temps réel en 2D (culture cellulaire) et 3D
(organoïdes et assembloïdes murins et humains).
-Effectuer l'analyse et l'interprétation des résultats,
-Participer à la rédaction des manuscrits scientifiques.
-Partager ses connaissances et son expertise avec les équipes de l'IGFL lors de séminaires
internes et de réunions ciblées.
-Une fois formé.e, assurer en tant qu'expert la responsabilité du suivi, de l'encadrement et de
la formation des membres de l'institut pour les systèmes d'imagerie par bioluminescences (e.g.
Olympus LV200 pour l'imagerie de cultures cellulaires 2D et 3D et de cultures organotypiques)
pour l'enregistrement en temps réel de l'expression des gènes dans tous ces systèmes ex vivo.


**Activités sur le plateau technique d'imagerie et d'analyse d'image IGFL (30%)**
-Renforcer les supports déjà existants et mutualisés sur le plateau, experts dans différents
domaines de la microscopie.
-Accompagner les développements technologiques et assurer la gestion et la formation de nouveaux
utilisateurs.

Compétences

Connaissances :
- Bonnes connaissances générales en biologie et physiologie animale
- Bonnes compétences en biologie cellulaire

Savoir-faire opérationnels :
- expertise théorique et pratique sur les systèmes de culture 2D et 3D et leur imagerie et les
bases théoriques de l'analyse d'images.

Savoir-être :
- excellentes qualités relationnelles et un sens aiguisé du service
- Une bonne connaissance et pratique de la langue anglaise est indispensable.

Contexte de travail

L'Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL), UMR 5242 CNRS/ENS de Lyon/UCBL et USC
INRAE regroupe 13 équipes de recherche, 4 plateformes techniques (Sequençage, Imagerie,
Experimentation du vivant et Analyses de données) et des services supports (Administration et
Finance, Logistique et Sécurité, Informatique). Il regroupe env. 120 personnels permanents et
contractuels sur le site de Lyon-Gerland sur le Campus de l'ENS de Lyon.
Dédié à la science de la découverte, l'IGFL met en place une recherche dite « fondamentale »
qui vise à faire progresser la connaissance: à comprendre le vivant, en particulier comment le
génome façonne le développement, la physiologie et l'évolution des organismes multicellulaires
et pour ce faire nous étudions des organismes modèles et non modèles.
L'équipe d'accueil principale étudie les voies moléculaires et épigénétiques qui contrôlent les
oscillateurs biologiques, en particulier les horloges circadiennes, en utilisant des modèles
murins (imagerie in vivo, organoïdes murins et humains). Spécifiquement, cette équipe
s'intéresse aux état de la chromatine et leur rôle dans le contrôle de la physiologie
cellulaire. L'ingénieur sera amené à collaborer avec les autres équipes de l'unité souhaitant
développer des modèles organoïdes.
Le plateau technique d'imagerie de l'IGFL comprend actuellement de nombreux microscopes dont
deux microscopes confocaux, des stations d'analyse d'image (http://igfl.ens-lyon.fr/offres-et-
technologies/platforms/microscopie). Il inclut une pièce dédiée à l'histologie et à la
préparation d'échantillon. Les équipes de l'IGFL sont pour la plupart de grandes utilisatrices
du plateau qui ne cesse de prendre de l'ampleur, avec une spécialisation dans l'imagerie sur
organisme entier. L'utilisation des logiciels d'analyse d'image demande une expertise dans le
domaine et les nouveaux utilisateurs doivent être formés et accompagnés.